云南师范大学基础教育集团办公室是集团日常工作管理机构，集团办公室下设综合事务部、人力资源部、计划财务部、合作办学部、师训德育部和后勤保障部等六个部门。综合事务部承办集团办公室日常行政事务；承担集团合作学校、幼儿园党群工作，执行上级党委决定，组织贯彻党的路线、方针、政策，包括党建、群团、纪检、信访、党风廉政建设等工作。人力资源部按照国家及云南师范大学人事工作政策，负责集团办公室人事管理工作，规范各直属幼儿园及合作学校人事管理工作。计划财务部代表集团办公室履行对学校计财处的工作业务往来，履行对集团合作学校幼儿园进行工作业务协调、服务、指导和管理等职能。合作办学部承担集团对外合作办学的项目策划、联系、洽谈、实施、建设及项目推进工作；负责合作学校的督导、考核评价、教学管理和安全管理；协助集团专家指导委员会开展相关工作。师训德育部承担集团办公室合作学校教师培训、教研及教学质量监控工作；组织实施集团办公室合作学校教师招聘工作；协助集团专家指导委员会开展相关工作。负责集团各幼儿园和相关机构师训教研、保教工作、队伍建设等工作；组织协调对各幼儿园和相关机构的督导、检查和评估。后勤保障部代表集团办公室履行对集团成员学校、幼儿园的物资采购、资产管理、工程修缮业务的协调、服务、指导和管理等工作职能。